Объединенная промышленная редакция
Газета о промышленности
Газета для промышленников
Промышленный еженедельник
Независимая межотраслевая газета о промышленности
Издается с 2002 года
Выходит по понедельникам
 

НАВЕРХ

Разделы
Промышленный еженедельник
№36(669) 16-22 октября 2017

(свежий номер каждую среду)
Читайте в номере
Виват, КБП!!!
«Конструкторское бюро приборостроения» торжественно отметило 90-летний юбилей

SAS Forum Russia 2017
Курс на цифровую трансформацию отраслей

70-летний юбилей
Специальная пожарная охрана МЧС России

Три фактора здоровья планеты
Эксперты «Глобальной энергии» обсудили системные подходы

ARMS & Hunting 2017
Холдинг «Швабе» представил пять новинок

Авиационные перспективы
Гарантированная загрузка нижегородских предприятий

День России
Международная машиностроительная выставка MSV

Россия будущего
Как агломерации помогут российской экономике

В России и в Европе
Эксперты сравнили практику муниципальных территориальных преобразований

Секреты успеха
На ММИФ обсудили коммерциализацию научных идей

На полях IFSEC 2017
Обеспечение корпоративной информационной безопасности

«Атлант» для Yves Rocher
ID Logistics представила обновленную В2В и В2С платформу

Россия на FIHAV 2017
Выставка-ярмарка открывает дорогу на рынки Кубы и Латинской Америки

Оборудование для АЭС «Белене»
Ижорские заводы отгрузили второй корпус реактора

«Безопасность. Крым»
III специализированная выставка в Ялте
Проекты "ПЕ"
Подписка на электронную версию газеты
Дает преимущество во времени: на сайте газеты свежий номер выкладывается утром в среду, а подписчики электронную версию получают уже в понедельник до 10.00 утра (по Московскому времени).
Специальные проекты "ПЕ"
Социальные проекты "ПЕ"
Интервью
Николай Шелепин
«Только симбиоз науки и промышленности даст толчок развитию технологий»
Григорий Хренов
«Форум «Микроэлектроника» – крайне важная площадка, которая обеспечивает синергию развития всей электронной индустрии России»
Сергей Хвощ
«Перспективы и возможности развития электронной компонентной базы в России»
Сергей Тимошенков
«Форум «Микроэлектроника» дает возможность расти вместе со всем научным миром и идти в ногу со временем!»
Ферхат Йенибертиз
«Турция запускает новый глобальный выставочный проект»
Юрий Завалин
«Если опять время на обсуждение доклада будет превышать время самого доклада, значит мы добились своего!»
Елена Сельвич
«Зачем директору корпоративная культура?»
Дмитрий Колобов
«Наша задача – сформировать инфраструктуру детства...»
Андрей Кудимов
«Совместная работа производителя техники, производителя смазочного материала и операторов техники - залог успеха!»

Первая трехлетка

Лаборатория I-SCALARE в МФТИ представила результаты деятельности

Лаборатория I-SCALARE в МФТИ представила результаты деятельностиIntel и Московский физико-технический институт (МФТИ) подвели итоги работы лаборатории суперкомпьютерных технологий для биомедицины, фармакологии и малоразмерных структур I-SCALARE (Intel super computer applications laboratory for advanced research) за три года. Лаборатория была создана на базе МФТИ в 2010 году в рамках гранта Министерства образования и науки РФ при участии сотрудников института и корпорации Intel. Руководство лабораторией осуществляет д.т.н. Владимир Пентковский, известный разработчик программно-аппаратных архитектур, заслуженный исследователь Intel.

Основным направлением деятельности лаборатории является разработка проблемно-ориентированных архитектур вычислительных систем для задач биомедицины, фармакологии и малоразмерных структур. В качестве «целевых» были выбраны несколько прикладных вычислительных задач, связанных с моделированием вирусов, клеточных мембран, а также взаимодействия белков и внешних полей с клеточными мембранами. Все они, с одной стороны, имеют большую практическую ценность, а с другой — не могут быть решены на имеющихся вычислительных ресурсах и требуют новых подходов к архитектуре кластеров.
Для проведения широкого спектра исследований в рамках деятельности лаборатории используется инновационный и энергоэффективный суперкомпьютер на базе высокопроизводительных серверных процессоров Intel Xeon E5-2690, разработанный и установленный специалистами группы компаний РСК. Использование старших моделей процессоров семейства Intel Xeon E5-2600 стало возможным благодаря применению передовой технологии жидкостного охлаждения, лежащей в основе архитектуры «РСК Торнадо».
Пиковая производительность суперкомпьютера на данный момент составляет 83,14 TFLOPS при занимаемой площади менее чем 4 кв.м. Кластер состоит из двух вычислительных стоек, содержащих в сумме 224 вычислительных узла на базе серверных плат Intel S2600JF и двух процессоров Intel Xeon E5-2690 в каждом (всего 448 процессоров, 3584 ядра). При этом обеспечивается поддержка большого объема оперативной памяти на один узел — 64 ГБ, что суммарно составляет 14,3 ТБ ОЗУ для всей системы. Коммуникационная сеть построена на базе высокоскоростного интерфейса Infiniband QDR.
Расширение вычислительного кластера проводилось в три этапа, причем, на каждом из них архитектура вычислительной системы создавалась собственной группой лаборатории, отвечающей за разработку программных и аналитических моделей будущих вычислительных комплексов с последующим изучением их производительности на приложениях, решающих задачи молекулярной динамики. На текущий момент специалисты лаборатории успешно проводят моделирование систем, в 10 раз превышающих мощность установленного кластера, т.е. имеющие производительность до 830 TFLOPS, используя инструментарий Wind River Simics, Intel VTune Amplifier, а также технологии, разработанные в лаборатории.
Тестирование эффективности и производительности будущих вычислительных комплексов проводилось на приложениях, решающих био-медико-фармацевтические задачи. Биоинформатика и моделирование лекарственных препаратов — быстрорастущие области знаний, требующие использования высокопроизводительных вычислений. Понимание того, насколько эффективно будут исполняться программы на оборудовании, подчас еще только запланированном к эксплуатации, позволяет предвидеть и заранее устранить проблемы производительности, добиться наилучшей отдачи от дорогостоящей вычислительной системы.
Непрерывная адаптация архитектуры кластера к особенностям задач молекулярной динамики и биохимии, позволила российским ученым, использующим суперкомпьютер в исследовательских целях, добиться новых, уникальных результатов в данных направлениях.
Так, группа под руководством профессора Романа Ефремова из Института биоорганической химии РАН использует вычислительный кластер в МФТИ для исследований структуры и динамики белок-мембранных систем и конструирования нового класса антимикробных соединений на основе природных лантибиотиков. В ходе развития данного проекта, проведения расчетов и моделирования получены микросекундные траектории молекулярной динамики (МД) мишени действия антибиотиков — молекулы липида-II - в мембране бактерий. Модернизация суперкомпьютера позволила проводить более масштабные вычислительные эксперименты, увеличив размеры систем в 10 раз, а длительность траекторий молекулярной динамики — в 20 раз. Учеными было проведено детальное моделирование взаимодействия лантибиотиков с липидом-II в мембране и впервые установлено, что молекула-мишень (липид-II) создает в мембране бактерий специфический паттерн, эффективно распознаваемый спроектированными «ловушками» — потенциальными антибиотиками. В результате таких исследований была предложена атомистическая модель связывания «ловушка-мишень» — основа дальнейшего рационального дизайна новых антибиотиков. Данных результатов удалось добиться, осуществив анализ больших (до 2,2x105 атомов) систем на длительных (до 1 мкс) траекториях молекулярной динамики.
Благодаря значительным вычислительным возможностям кластера лаборатории I-SCALARE группе, возглавляемой академиком Николаем Зефировым и доцентом, к.т.н. Владимиром Палюлиным, удалось выполнить пионерские работы в двух областях — моделирование оболочки флавивирусов и молекулярная динамика важнейшего нейрорецептора NMDA.
Идея подпроекта по моделированию оболочки флавивирусов заключается в применении метода молекулярной динамики к системам, содержащим десятки миллионов атомов. Флавивирусы — это оболочечные вирусы, вызывающие такие заболевания, как клещевой энцефалит и лихорадки Западного Нила и Денге. Процесс проникновения флавивирусов в клетку человека сопряжен со значительной структурной перестройкой белков оболочки; одной из задач лаборатории является моделирование этого процесса в полноатомном масштабе. Моделирование систем такого размера с использованием современных вычислительных средств пока является крайне обременительным, но вычислители следующего поколения должны быть способны адекватно работать с ними. К настоящему времени на суперкомпьютере лаборатории I-SCALARE выполнено моделирование молекулярной динамики мембраны вирусной частицы, состоящей из 1,5 млн атомов. На основе моделирования белков оболочки вируса предложены вещества, обладающие противовирусной активностью по отношению к вирусу клещевого энцефалита (биологические испытания проведены в ФГБУ «Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П.Чумакова» РАМН).
Моделирование молекулярной динамики рецептора NMDA является основой для компьютерного конструирования химических соединений, которые позволяют управлять его работой и могут использоваться для лечения болезней Альцгеймера, Паркинсона и других нейродегенеративных возрастных заболеваний. Вычислительная сложность этой задачи связана с необходимостью моделирования эволюции сложной надмолекулярной системы (рецептор в липидной мембране с водным окружением, всего более 360 тысяч атомов) на протяжении достаточно длительного времени. Благодаря возможностям суперкомпьютера лаборатории I-SCALARE было выполнено моделирование поведения рецептора в различных условиях, изучен механизм действия его модуляторов и предложен ряд перспективных веществ для биологических испытаний.
Стоит отметить, что лаборатория I-SCALARE осуществляет не только научную, но и учебную деятельность. Ее сотрудниками был разработан учебный курс по использованию симуляторов для моделирования различных вычислительных систем. Кроме того, в лаборатории регулярно проводятся научные семинары, а Владимир Пентковский стал научным руководителем нескольких аспирантов и студентов МФТИ.

ПОДВЕРСТКА
Московский физико-технический институт создан в 1951 году на основе физико-технического факультета МГУ (1946-1951). Институт осуществляет подготовку специалистов высшей квалификации в различных областях современной науки и техники. Основателями и сотрудниками института были лауреаты Нобелевской премии П.Л. Капица, Н.Н. Семенов, Л.Д. Ландау. Многие ведущие российские ученые являются профессорами МФТИ. Среди них более 80 академиков и членов-корреспондентов Российской академии наук.

Группа компаний РСК — ведущий в России и СНГ разработчик и интегратор «полного цикла» суперкомпьютерных решений нового поколения на основе архитектур корпорации Intel и передового жидкостного охлаждения, а также целого ряда собственных ноу-хау. Существующий потенциал компании позволяет: создавать самые энергоэффективные решения с рекордным показателем эффективности использования электроэнергии (PUE), реализовать самую высокую вычислительную плотность в индустрии на базе стандартных процессоров архитектуры x86, использовать полностью «зеленый» дизайн, обеспечить высочайшую надежность решения, полную бесшумность работы вычислительных модулей, 100% совместимость и гарантированную масштабируемость, при этом достигается беспрецедентно низкая стоимость владения и невысокий уровень энергопотребления. Кроме того, специалисты РСК имеют опыт разработки и внедрения интегрированного программного стека решений для повышения эффективности работы и прикладного использования суперкомпьютерных комплексов: от системного ПО до вертикально-ориентированных платформ на базе технологии облачных вычислений.
РСК является партнером корпорации Intel по программе Intel Technology Provider Program высшего уровня Platinum. Производительность и масштабируемость решений на базе архитектуры «РСК Торнадо» подтверждена сертификатом Intel Cluster Ready.
Поиск по сайту
Национальная премия
«Золотая идея»
Industrial Daily ЭКСПО-2017
Самое важное
«ТОП-10 2017 года» открыт для заявок
Конкурс Минпромторга России среди российских производителей легпрома
Микроэлектроника меняет мир
Пленарное заседание III Международного форума «Микроэлектроника-2017» прошло под девизом «Микроэлектроника меняет мир»
В Алуште начинается III Международный форум «Микроэлектроника-2017»
Представители научно-исследовательских институтов, проектных центров и производственных компаний радиоэлектронной отрасли прибывают в Алушту (Крым) для участия в III Международном форуме «Микроэлектроника-2017»
Высокий знак качества ВТС
Книга-альбом о Национальной премии «Золотая идея»
ВЭФ-2017
На полях ВЭФ-2017 будет подписано соглашение о финансировании Дальневосточного фонда развития и внедрения высоких технологий
EMO Hannover 2017 – дополнительные мероприятия посвящены тенденциям производственных технологий
EMO Hannover – выставка номер один в мире в секторе металлообработки – вновь откроет свои двери с 18 по 23 сентября 2017
Вопросы интеллектуальной собственности обсудят на третьем Восточном экономическом форуме
В рамках ВЭФ ожидается проведение международного форума на тему «Интеллектуальная собственность: инструменты регионального развития»
Восточный экономический форум
Заместитель премьера Государственного совета КНР Ван Ян подтвердил участие в третьем Восточном экономическом форуме
Рособоронэкспорт провел первое заседание пресс-клуба
В главном офисе АО "Рособоронэкспорт" в Москве состоялось первое заседание пресс-клуба спецэкспортера
Определена основная тема Международного Форума «Микроэлектроника 2017»
Со 2 по 7 октября 2017 года, в Алуште (Республика Крым), пройдет Третий Международный форум «Микроэлектроника 2017»
Опубликован список ключевых спискеров ИННОПРОМ-2017
Иностранные министры, CEO крупнейших глобальных промышленных корпораций и представители органов власти России, Японии, Германии, Франции, Южной Кореи, главы международных профессиональных ассоциаций примут участие в ежегодной выставке
Что интересного на ИННОПРОМ-2017: новинки Международной промышленной выставки
Этим летом в Екатеринбурге соберутся представители около 600 промышленных компаний из 95 стран мира. Их цель - посещение VIII Международной промышленной выставки ИННОПРОМ-2017
Индия становится постоянным участником ИННОПРОМ
Не менее 40 индийских компаний примут участие в ИННОПРОМ-2017, они продемонстрируют свою продукцию из сектора промышленного инжиниринга
Более 110 экспертов собрались на Всероссийском саммите «Корпоративные закупки 2017 Summer Camp»
Организатор мероприятия - компания infor-media Russia, генеральным партнером выступила компания B2B-CENTER
История развития и становления Международного Форума «Микроэлектроника»
Со 2 по 7 октября в Алуште (Республика Крым) пройдет 3-й Международный Форум «Микроэлектроника-2017»
Россия вдвое увеличила площадь выставочной экспозиции на Российско-Китайском ЭКСПО-2017
14 июня в Харбине прошла пресс-конференция, посвящённая открытию IV Российско-Китайского ЭКСПО, которое состоится 15 июня 2017 года
IV Российско-Китайское ЭКСПО 2017: место встречи стран, регионов и компаний
Главными темами ЭКСПО станут инновации, сельское хозяйство и сотрудничество в сфере малого и среднего предпринимательства
Госкорпорация «Росатом» выступит со-организатором AACE Moscow Spring Workhop-2017
1 июня в Москве в рамках Международной конференции ПМСОФТ по управлению проектами состоится специализированный бизнес-семинар по лучшим практикам в области оценки и контроля стоимости проектов AACE Moscow Spring Workshop-2017
Российские промышленные компании выходят на рынок Алжира
В Алжире открыла работу юбилейная 50-я Международная Алжирская ярмарка FIA-2017
IV Российско-Китайское ЭКСПО
На IV Российско-Китайском ЭКСПО будут намечены новые точки роста торгово-экономического сотрудничества между Россией и Китаем
50-я Международная промышленная Алжирская выставка FIA-2017
Заместитель министра промышленности и торговли Российской Федерации Александр Морозов возглавит российскую делегацию на промышленной выставке в Алжире
ИННОПРОМ-2017
120 японских компаний уже подтвердили свое участие в национальной экспозиции Японии, основной акцент в которой будет сделан на станкостроении
IV российско-китайское ЭКСПО
В Министерстве коммерции КНР (г. Пекин) в конце апреля состоялось заседание организационного комитета Четвертого Российско-Китайского ЭКСПО
Партнерский статус Японии на ИННОПРОМ - сильное подспорье в экономическом развитии наших стран
В Минпромторге России состоялась встреча Георгия Каламанова, заместителя Министра промышленности и торговли, и делегации JETRO, японской организации по развитию внешней торговли
Мнения экспертов
Ирина Елисеева
Старший преподаватель УЦ «ФИНАМ»
Михаил Петрушин
Генеральный директор ООО «Зиракс»
Валерий Джермакян
КТН, советник, ООО «Юридическая фирма Городисский и Партнеры»
Ярослав Кабаков
Ректор УЦ «ФИНАМ»
Андрей Сапунов
Старший инвестиционный консультант ИК «ФИНАМ»
Ждан Шакиров
Старший преподаватель УЦ «ФИНАМ»
Издания:
"Оборонно-промышленный комплекс РФ" "Russian Aviation & Military Guide" "Российская муниципальная практика" "Русский инженер" "Объединенное машиностроение"
Оборонно-промышленный комплекс РФ
Russian Aviation & Military Guide
Российская муниципальная практика
Русский инженер
Объединенное машиностроение
"Industrial Weekly" "Высокоточные комплексы" "High-Precision Weapons" "Ударник" "Energy Russia"
Industrial Weekly
Высокоточные комплексы
High-Precision Weapons
Ударник
Energy Russia
"Show-daily АРМИЯ-2016" "Show-daily АРМИЯ-2017" "Russian Energy & Technology Guide" "Уралмаш Нефтегазовое Оборудование Холдинг" "Актуальная энергетика"
Show-daily АРМИЯ-2016
Show-daily АРМИЯ-2017
Russian Energy & Technology Guide
Уралмаш Нефтегазовое Оборудование Холдинг
Актуальная энергетика
"Industrial Daily
ИННОПРОМ-2017"
"Industrial Daily
ЭКСПО-2017 Астана"
"Industrial Daily
ИНТЕРПОЛИТЕХ-2017"
"Общероссийский
журнал РАДИОФРОНТ"
Industrial Daily ИННОПРОМ-2017
Industrial Daily ЭКСПО-2017 Астана
Industrial Daily Интерполитех-2017
Общероссийский научно-популярный журнал «РАДИОФРОНТ»
 
Металл Фото Арт Фестиваль промышленной фотографии Московский клуб промышленных журналистов Премия имени Никиты Кириченко
Московский клуб промышленных журналистов
Московский клуб промышленной журналистики.
Учредитель и издатель:
ООО «Редакция газеты «Промышленный еженедельник». Издание зарегистрировано в Министерстве Российской Федерации по делам печати, телерадиовещания и средств массовой информации.
Подписка:
Распространяется по подписке, в розницу, по прямой рассылке и на профессиональных мероприятиях. Подписаться на «Промышленный еженедельник» можно в любом отделении связи РФ и СНГ.
Индекс для подписчиков:
По каталогам «Роспечать» и «Пресса России»: индекс для инд. подписчиков - 45774, для организаций - 83475; по каталогу «Почта России»: индекс для инд. подписчиков - 10887, индекс для организаций - 10888.
Адрес для корреспонденции:
123104, Москва, а/я 29,
«Промышленная редакция»
Телефоны редакции:
(495) 729-39-77
(495) 778-14-47
Интернет: www.promweekly.ru
E-mail: doc@promweekly.ru
  
Copyright © 2002-2017 Промышленный еженедельник - независимая межотраслевая
газета о промышленности