Объединенная промышленная редакция
Газета о промышленности
Газета для промышленников
Промышленный еженедельник
Независимая межотраслевая газета о промышленности
Издается с 2002 года
Выходит по понедельникам
 

НАВЕРХ

Разделы
Промышленный еженедельник
№27(660) 14-20 августа 2017

(свежий номер каждую среду)
Читайте в номере
Авиа индустрия 4.0
Минпромторг России и ряд высокотехнологичных компаний представили масштабный цифровой проект

ВЭФ-2017
17 дальневосточных территорий опережающего развития

«Арктика-2018»
Началась подготовка международной конференции

Инвестиции Ростех
Госкорпорация Ростех до конца 2017 года введет в строй еще 10 перинатальных центров в регионах РФ

«Производственный инкубатор»
На Уралмашзаводе стартовала программа по подготовке рабочих кадров

Воровать - нехорошо!
Специалисты МРСК Центра пресекли около 6 тыс. случаев

После модернизации
Гидроагрегат № 7 Жигулевской ГЭС увеличил мощность

Усиленная подготовка
Красноярские энергетики работают в интересах зимы

Расчет денег
В марокканском городе Марракеше состоялся очередной Всемирный статистический конгресс

Рост на 1,7 %
Потребление электроэнергии в ЕЭС России в июле 2017 года

Balex Delta 2017
Международные методики ликвидации разливов нефти

Рейтинг программ CRN
«ЭкоЭксперты» компании Schneider Electric получили 5 звезд

ДОМ ТЕХНОНИКОЛЬ
Презентована комплексная концепция домостроения

Концерн «Созвездие»
Ростех утвердил новый менеджмент

Серая почта
Сотрудники службы безопасности Почты России изъяли из доставочной сети свыше 65 тыс. писем
Проекты "ПЕ"
Подписка на электронную версию газеты
Дает преимущество во времени: на сайте газеты свежий номер выкладывается утром в среду, а подписчики электронную версию получают уже в понедельник до 10.00 утра (по Московскому времени).
Специальные проекты "ПЕ"
Социальные проекты "ПЕ"
Интервью
Андрей Кудимов
«Совместная работа производителя техники, производителя смазочного материала и операторов техники - залог успеха!»
Гасан Гасангаджиев
«Первые четыре года мы чуть ли не каждый день работали до трех-четырех утра, и выходных у нас не было»
Елена Панина
«Московской Конфедерации промышленников и предпринимателей (работодателей) 25 лет: много сделано и многое предстоит!»
Алексей Захарьев
«Платить экологический сбор нужно было вчера»
Олег Сердюков
«Полагаясь на опыт, компетенции и авторские разработки, мы находим решения специфических задач...»
Евгений Григорьев
«Управление данными сделает бизнес более эффективным»
Амур Канчавели
«Российская экономика остро нуждается в новом этапе развития своего экспорта, а опереться в этом новом - слава Богу, есть на что»
Гасан Гасангаджиев
«Сегодня уже невозможно линейкой, на которой от времени стерлись деления, измерить что-то с необходимой степенью точности»

Первая трехлетка

Лаборатория I-SCALARE в МФТИ представила результаты деятельности

Лаборатория I-SCALARE в МФТИ представила результаты деятельностиIntel и Московский физико-технический институт (МФТИ) подвели итоги работы лаборатории суперкомпьютерных технологий для биомедицины, фармакологии и малоразмерных структур I-SCALARE (Intel super computer applications laboratory for advanced research) за три года. Лаборатория была создана на базе МФТИ в 2010 году в рамках гранта Министерства образования и науки РФ при участии сотрудников института и корпорации Intel. Руководство лабораторией осуществляет д.т.н. Владимир Пентковский, известный разработчик программно-аппаратных архитектур, заслуженный исследователь Intel.

Основным направлением деятельности лаборатории является разработка проблемно-ориентированных архитектур вычислительных систем для задач биомедицины, фармакологии и малоразмерных структур. В качестве «целевых» были выбраны несколько прикладных вычислительных задач, связанных с моделированием вирусов, клеточных мембран, а также взаимодействия белков и внешних полей с клеточными мембранами. Все они, с одной стороны, имеют большую практическую ценность, а с другой — не могут быть решены на имеющихся вычислительных ресурсах и требуют новых подходов к архитектуре кластеров.
Для проведения широкого спектра исследований в рамках деятельности лаборатории используется инновационный и энергоэффективный суперкомпьютер на базе высокопроизводительных серверных процессоров Intel Xeon E5-2690, разработанный и установленный специалистами группы компаний РСК. Использование старших моделей процессоров семейства Intel Xeon E5-2600 стало возможным благодаря применению передовой технологии жидкостного охлаждения, лежащей в основе архитектуры «РСК Торнадо».
Пиковая производительность суперкомпьютера на данный момент составляет 83,14 TFLOPS при занимаемой площади менее чем 4 кв.м. Кластер состоит из двух вычислительных стоек, содержащих в сумме 224 вычислительных узла на базе серверных плат Intel S2600JF и двух процессоров Intel Xeon E5-2690 в каждом (всего 448 процессоров, 3584 ядра). При этом обеспечивается поддержка большого объема оперативной памяти на один узел — 64 ГБ, что суммарно составляет 14,3 ТБ ОЗУ для всей системы. Коммуникационная сеть построена на базе высокоскоростного интерфейса Infiniband QDR.
Расширение вычислительного кластера проводилось в три этапа, причем, на каждом из них архитектура вычислительной системы создавалась собственной группой лаборатории, отвечающей за разработку программных и аналитических моделей будущих вычислительных комплексов с последующим изучением их производительности на приложениях, решающих задачи молекулярной динамики. На текущий момент специалисты лаборатории успешно проводят моделирование систем, в 10 раз превышающих мощность установленного кластера, т.е. имеющие производительность до 830 TFLOPS, используя инструментарий Wind River Simics, Intel VTune Amplifier, а также технологии, разработанные в лаборатории.
Тестирование эффективности и производительности будущих вычислительных комплексов проводилось на приложениях, решающих био-медико-фармацевтические задачи. Биоинформатика и моделирование лекарственных препаратов — быстрорастущие области знаний, требующие использования высокопроизводительных вычислений. Понимание того, насколько эффективно будут исполняться программы на оборудовании, подчас еще только запланированном к эксплуатации, позволяет предвидеть и заранее устранить проблемы производительности, добиться наилучшей отдачи от дорогостоящей вычислительной системы.
Непрерывная адаптация архитектуры кластера к особенностям задач молекулярной динамики и биохимии, позволила российским ученым, использующим суперкомпьютер в исследовательских целях, добиться новых, уникальных результатов в данных направлениях.
Так, группа под руководством профессора Романа Ефремова из Института биоорганической химии РАН использует вычислительный кластер в МФТИ для исследований структуры и динамики белок-мембранных систем и конструирования нового класса антимикробных соединений на основе природных лантибиотиков. В ходе развития данного проекта, проведения расчетов и моделирования получены микросекундные траектории молекулярной динамики (МД) мишени действия антибиотиков — молекулы липида-II - в мембране бактерий. Модернизация суперкомпьютера позволила проводить более масштабные вычислительные эксперименты, увеличив размеры систем в 10 раз, а длительность траекторий молекулярной динамики — в 20 раз. Учеными было проведено детальное моделирование взаимодействия лантибиотиков с липидом-II в мембране и впервые установлено, что молекула-мишень (липид-II) создает в мембране бактерий специфический паттерн, эффективно распознаваемый спроектированными «ловушками» — потенциальными антибиотиками. В результате таких исследований была предложена атомистическая модель связывания «ловушка-мишень» — основа дальнейшего рационального дизайна новых антибиотиков. Данных результатов удалось добиться, осуществив анализ больших (до 2,2x105 атомов) систем на длительных (до 1 мкс) траекториях молекулярной динамики.
Благодаря значительным вычислительным возможностям кластера лаборатории I-SCALARE группе, возглавляемой академиком Николаем Зефировым и доцентом, к.т.н. Владимиром Палюлиным, удалось выполнить пионерские работы в двух областях — моделирование оболочки флавивирусов и молекулярная динамика важнейшего нейрорецептора NMDA.
Идея подпроекта по моделированию оболочки флавивирусов заключается в применении метода молекулярной динамики к системам, содержащим десятки миллионов атомов. Флавивирусы — это оболочечные вирусы, вызывающие такие заболевания, как клещевой энцефалит и лихорадки Западного Нила и Денге. Процесс проникновения флавивирусов в клетку человека сопряжен со значительной структурной перестройкой белков оболочки; одной из задач лаборатории является моделирование этого процесса в полноатомном масштабе. Моделирование систем такого размера с использованием современных вычислительных средств пока является крайне обременительным, но вычислители следующего поколения должны быть способны адекватно работать с ними. К настоящему времени на суперкомпьютере лаборатории I-SCALARE выполнено моделирование молекулярной динамики мембраны вирусной частицы, состоящей из 1,5 млн атомов. На основе моделирования белков оболочки вируса предложены вещества, обладающие противовирусной активностью по отношению к вирусу клещевого энцефалита (биологические испытания проведены в ФГБУ «Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П.Чумакова» РАМН).
Моделирование молекулярной динамики рецептора NMDA является основой для компьютерного конструирования химических соединений, которые позволяют управлять его работой и могут использоваться для лечения болезней Альцгеймера, Паркинсона и других нейродегенеративных возрастных заболеваний. Вычислительная сложность этой задачи связана с необходимостью моделирования эволюции сложной надмолекулярной системы (рецептор в липидной мембране с водным окружением, всего более 360 тысяч атомов) на протяжении достаточно длительного времени. Благодаря возможностям суперкомпьютера лаборатории I-SCALARE было выполнено моделирование поведения рецептора в различных условиях, изучен механизм действия его модуляторов и предложен ряд перспективных веществ для биологических испытаний.
Стоит отметить, что лаборатория I-SCALARE осуществляет не только научную, но и учебную деятельность. Ее сотрудниками был разработан учебный курс по использованию симуляторов для моделирования различных вычислительных систем. Кроме того, в лаборатории регулярно проводятся научные семинары, а Владимир Пентковский стал научным руководителем нескольких аспирантов и студентов МФТИ.

ПОДВЕРСТКА
Московский физико-технический институт создан в 1951 году на основе физико-технического факультета МГУ (1946-1951). Институт осуществляет подготовку специалистов высшей квалификации в различных областях современной науки и техники. Основателями и сотрудниками института были лауреаты Нобелевской премии П.Л. Капица, Н.Н. Семенов, Л.Д. Ландау. Многие ведущие российские ученые являются профессорами МФТИ. Среди них более 80 академиков и членов-корреспондентов Российской академии наук.

Группа компаний РСК — ведущий в России и СНГ разработчик и интегратор «полного цикла» суперкомпьютерных решений нового поколения на основе архитектур корпорации Intel и передового жидкостного охлаждения, а также целого ряда собственных ноу-хау. Существующий потенциал компании позволяет: создавать самые энергоэффективные решения с рекордным показателем эффективности использования электроэнергии (PUE), реализовать самую высокую вычислительную плотность в индустрии на базе стандартных процессоров архитектуры x86, использовать полностью «зеленый» дизайн, обеспечить высочайшую надежность решения, полную бесшумность работы вычислительных модулей, 100% совместимость и гарантированную масштабируемость, при этом достигается беспрецедентно низкая стоимость владения и невысокий уровень энергопотребления. Кроме того, специалисты РСК имеют опыт разработки и внедрения интегрированного программного стека решений для повышения эффективности работы и прикладного использования суперкомпьютерных комплексов: от системного ПО до вертикально-ориентированных платформ на базе технологии облачных вычислений.
РСК является партнером корпорации Intel по программе Intel Technology Provider Program высшего уровня Platinum. Производительность и масштабируемость решений на базе архитектуры «РСК Торнадо» подтверждена сертификатом Intel Cluster Ready.
Поиск по сайту
Industrial Daily ИННОПРОМ-2017
EXPO 2017 ASTANA
Show-daily АРМИЯ-2017
Самое важное
EMO Hannover 2017 – дополнительные мероприятия посвящены тенденциям производственных технологий
EMO Hannover – выставка номер один в мире в секторе металлообработки – вновь откроет свои двери с 18 по 23 сентября 2017
Вопросы интеллектуальной собственности обсудят на третьем Восточном экономическом форуме
В рамках ВЭФ ожидается проведение международного форума на тему «Интеллектуальная собственность: инструменты регионального развития»
Восточный экономический форум
Заместитель премьера Государственного совета КНР Ван Ян подтвердил участие в третьем Восточном экономическом форуме
Рособоронэкспорт провел первое заседание пресс-клуба
В главном офисе АО "Рособоронэкспорт" в Москве состоялось первое заседание пресс-клуба спецэкспортера
Определена основная тема Международного Форума «Микроэлектроника 2017»
Со 2 по 7 октября 2017 года, в Алуште (Республика Крым), пройдет Третий Международный форум «Микроэлектроника 2017»
Опубликован список ключевых спискеров ИННОПРОМ-2017
Иностранные министры, CEO крупнейших глобальных промышленных корпораций и представители органов власти России, Японии, Германии, Франции, Южной Кореи, главы международных профессиональных ассоциаций примут участие в ежегодной выставке
Что интересного на ИННОПРОМ-2017: новинки Международной промышленной выставки
Этим летом в Екатеринбурге соберутся представители около 600 промышленных компаний из 95 стран мира. Их цель - посещение VIII Международной промышленной выставки ИННОПРОМ-2017
Индия становится постоянным участником ИННОПРОМ
Не менее 40 индийских компаний примут участие в ИННОПРОМ-2017, они продемонстрируют свою продукцию из сектора промышленного инжиниринга
Более 110 экспертов собрались на Всероссийском саммите «Корпоративные закупки 2017 Summer Camp»
Организатор мероприятия - компания infor-media Russia, генеральным партнером выступила компания B2B-CENTER
История развития и становления Международного Форума «Микроэлектроника»
Со 2 по 7 октября в Алуште (Республика Крым) пройдет 3-й Международный Форум «Микроэлектроника-2017»
Россия вдвое увеличила площадь выставочной экспозиции на Российско-Китайском ЭКСПО-2017
14 июня в Харбине прошла пресс-конференция, посвящённая открытию IV Российско-Китайского ЭКСПО, которое состоится 15 июня 2017 года
IV Российско-Китайское ЭКСПО 2017: место встречи стран, регионов и компаний
Главными темами ЭКСПО станут инновации, сельское хозяйство и сотрудничество в сфере малого и среднего предпринимательства
Госкорпорация «Росатом» выступит со-организатором AACE Moscow Spring Workhop-2017
1 июня в Москве в рамках Международной конференции ПМСОФТ по управлению проектами состоится специализированный бизнес-семинар по лучшим практикам в области оценки и контроля стоимости проектов AACE Moscow Spring Workshop-2017
Российские промышленные компании выходят на рынок Алжира
В Алжире открыла работу юбилейная 50-я Международная Алжирская ярмарка FIA-2017
IV Российско-Китайское ЭКСПО
На IV Российско-Китайском ЭКСПО будут намечены новые точки роста торгово-экономического сотрудничества между Россией и Китаем
Мнения экспертов
Ирина Елисеева
Старший преподаватель УЦ «ФИНАМ»
Михаил Петрушин
Генеральный директор ООО «Зиракс»
Валерий Джермакян
КТН, советник, ООО «Юридическая фирма Городисский и Партнеры»
Ярослав Кабаков
Ректор УЦ «ФИНАМ»
Андрей Сапунов
Старший инвестиционный консультант ИК «ФИНАМ»
Ждан Шакиров
Старший преподаватель УЦ «ФИНАМ»
Издания:
"Оборонно-промышленный комплекс РФ" "Russian Aviation & Military Guide" "Российская муниципальная практика" "Русский инженер" "Объединенное машиностроение"
Оборонно-промышленный комплекс РФ
Russian Aviation & Military Guide
Российская муниципальная практика
Русский инженер
Объединенное машиностроение
"Industrial Weekly" "Высокоточные комплексы" "High-Precision Weapons" "Ударник" "Energy Russia"
Industrial Weekly
Высокоточные комплексы
High-Precision Weapons
Ударник
Energy Russia
"Show-daily АРМИЯ-2016" "Show-daily АРМИЯ-2017" "Russian Energy & Technology Guide" "Уралмаш Нефтегазовое Оборудование Холдинг" "Актуальная энергетика"
Show-daily АРМИЯ-2016
Show-daily АРМИЯ-2017
Russian Energy & Technology Guide
Уралмаш Нефтегазовое Оборудование Холдинг
Актуальная энергетика
"Industrial Daily ИННОПРОМ-2017"
Industrial Daily ИННОПРОМ-2017
 
 
 
 
Металл Фото Арт Фестиваль промышленной фотографии Московский клуб промышленных журналистов Премия имени Никиты Кириченко
Московский клуб промышленных журналистов
Московский клуб промышленной журналистики.
Учредитель и издатель:
ООО «Редакция газеты «Промышленный еженедельник». Издание зарегистрировано в Министерстве Российской Федерации по делам печати, телерадиовещания и средств массовой информации.
Подписка:
Распространяется по подписке, в розницу, по прямой рассылке и на профессиональных мероприятиях. Подписаться на «Промышленный еженедельник» можно в любом отделении связи РФ и СНГ.
Индекс для подписчиков:
По каталогам «Роспечать» и «Пресса России»: индекс для инд. подписчиков - 45774, для организаций - 83475; по каталогу «Почта России»: индекс для инд. подписчиков - 10887, индекс для организаций - 10888.
Адрес для корреспонденции:
123104, Москва, а/я 29,
«Промышленная редакция»
Телефоны редакции:
(495) 729-39-77
(495) 778-14-47
Интернет: www.promweekly.ru
E-mail: doc@promweekly.ru
  
Copyright © 2002-2017 Промышленный еженедельник - независимая межотраслевая
газета о промышленности